Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
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LAMA3Q16787 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
LAMA3Q16787 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LAMA3Q16787 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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