Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms