Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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