Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNCBQ16143 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNCBQ16143 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.1 ms