Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ZFHX3Q15911 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZFHX3Q15911 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms