Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
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