Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNA6Q15825 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNA6Q15825 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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