Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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SIX1Q15475 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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SIX1Q15475 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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SIX1Q15475 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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SIX1Q15475 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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SIX1Q15475 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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SIX1Q15475 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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SIX1Q15475 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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SIX1Q15475 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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SIX1Q15475 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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SIX1Q15475 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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SIX1Q15475 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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SIX1Q15475 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SIX1Q15475 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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