Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms