Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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COL19A1Q14993 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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COL19A1Q14993 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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COL19A1Q14993 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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COL19A1Q14993 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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COL19A1Q14993 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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COL19A1Q14993 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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