Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMCO1Q147U7 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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