Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQLEQ14534 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms