Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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