Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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