Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRQ13535 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRQ13535 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRQ13535 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRQ13535 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRQ13535 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRQ13535 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRQ13535 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATRQ13535 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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