Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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