Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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