Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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CBX3Q13185 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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CBX3Q13185 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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