Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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IFT88Q13099 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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IFT88Q13099 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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IFT88Q13099 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
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IFT88Q13099 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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IFT88Q13099 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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IFT88Q13099 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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