Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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