Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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PGGT1BP53609 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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PGGT1BP53609 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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PGGT1BP53609 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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PGGT1BP53609 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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