Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPREP23469 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPREP23469 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPREP23469 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPREP23469 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPREP23469 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPREP23469 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPREP23469 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPREP23469 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPREP23469 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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