Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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RTN1Q16799 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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RTN1Q16799 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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RTN1Q16799 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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RTN1Q16799 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTN1Q16799 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTN1Q16799 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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