Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDK4Q16654 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms