Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SGCBQ16585 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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