Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms