Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USF2Q15853 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
USF2Q15853 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USF2Q15853 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
USF2Q15853 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USF2Q15853 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USF2Q15853 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
USF2Q15853 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
USF2Q15853 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
USF2Q15853 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
USF2Q15853 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USF2Q15853 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
USF2Q15853 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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