Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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