Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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ALX1Q15699 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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ALX1Q15699 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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ALX1Q15699 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
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ALX1Q15699 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ALX1Q15699 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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