Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H2Q13888 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H2Q13888 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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