Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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