Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRQ13535 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRQ13535 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRQ13535 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
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