Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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MKRN4PQ13434 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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MKRN4PQ13434 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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MKRN4PQ13434 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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MKRN4PQ13434 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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MKRN4PQ13434 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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