Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms