Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MSLNQ13421 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms