Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SP140Q13342 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SP140Q13342 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SP140Q13342 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SP140Q13342 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SP140Q13342 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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SP140Q13342 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SP140Q13342 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SP140Q13342 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SP140Q13342 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SP140Q13342 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SP140Q13342 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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