Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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SGCGQ13326 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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SGCGQ13326 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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SGCGQ13326 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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SGCGQ13326 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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SGCGQ13326 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCGQ13326 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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