Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RIGQ13278 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RIGQ13278 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RIGQ13278 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RIGQ13278 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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