Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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NR1H3Q13133 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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NR1H3Q13133 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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NR1H3Q13133 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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NR1H3Q13133 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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NR1H3Q13133 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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NR1H3Q13133 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NR1H3Q13133 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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