Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms