Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1BQ13112 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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