Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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