Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GPS1Q13098 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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