Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN3Q13064 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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