Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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