Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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PGGT1BP53609 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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PGGT1BP53609 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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PGGT1BP53609 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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PGGT1BP53609 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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PGGT1BP53609 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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PGGT1BP53609 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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