Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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PTPRMP28827 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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PTPRMP28827 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRMP28827 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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