Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP9BO43861 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms