Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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