Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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SGF29Q96ES7 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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SGF29Q96ES7 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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SGF29Q96ES7 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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SGF29Q96ES7 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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SGF29Q96ES7 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGF29Q96ES7 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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